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    miRNA實(shí)驗(yàn)解決方案(操作手冊(cè))---第一章:miRNA簡(jiǎn)介

    發(fā)布時(shí)間: 2025-01-07  點(diǎn)擊次數(shù): 125次

    一、miRNA的合成途徑
    在動(dòng)物細(xì)胞核中,
    miRNA基因的初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物Pri-miRNA(長(zhǎng)度大約為300~1000 nt)被RNase IIl-Drosha 酶切割成為發(fā)夾結(jié)構(gòu)前體 miRNA(Pre-miRNA,長(zhǎng)度大約為70~100nt)。經(jīng)過(guò)初步剪切后,Pre-miRNA在轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白Exportin-5的作用下由細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)中,然后由另一種RNase Ill-Dicer 酶進(jìn)一步切割產(chǎn)生成熟的miRNA(長(zhǎng)度大約為21~23 nt)。成熟的miRNA與類似RISC的核糖體蛋白結(jié)合形成miRNA-RISC復(fù)合體,從而引起靶mRNA降解或者翻譯抑制。miRNA參與胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞死亡、免疫調(diào)節(jié)以及物質(zhì)代謝等過(guò)程。

    植物miRNA的形成過(guò)程全部是在細(xì)胞核中完成的,不存在Pre-miRNA從細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程。首先,細(xì)胞核中編碼miRNA的基因在RNA聚合酶II的作用下轉(zhuǎn)錄形成Pri-miRNA,然后在Dicer酶-DCL1的作用下形成Pre-miRNA,DCL1繼續(xù)作用于Pre-miRNA從而形成成熟的miRNA,以上過(guò)程均在細(xì)胞核中完成。成熟的miRNA或者是在細(xì)胞核中與類似RISC的核糖體蛋白結(jié)合形成miRNA-RISC復(fù)合體,然后被核轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白HST運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)中,或者是先被HST運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)中,再與核糖體蛋白結(jié)合形成miRNA-RISC復(fù)合體。miRNA影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育、激素的調(diào)節(jié)、信號(hào)的轉(zhuǎn)導(dǎo)、植物病害和應(yīng)答環(huán)境脅迫。


    二、miRNA的特性

    miRNA最典型的特性就是兩點(diǎn)--保守性和特異性。

    ·保守性

    miRNA的結(jié)構(gòu)和序列在物種之間幾乎保持不變。

    結(jié)構(gòu)的保守性:無(wú)論動(dòng)物體還是植物體,miRNA的生成途徑都是由莖環(huán)結(jié)構(gòu)的前體切割成為成熟體;

    序列的保守性:miRNA的序列在不同物種中的差距極小。

    ·特異性

    miRNA的表達(dá)分布具有時(shí)間區(qū)別和空間區(qū)別。

    時(shí)間的特異性:在個(gè)體不同的發(fā)育階段,miRNA的表達(dá)量不同;

    空間的特異性:在個(gè)體的不同組織中,miRNA的表達(dá)量不同。

    三、miRNA序列查找

    常用的查找miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)--miRBase和TarBase。

    該數(shù)據(jù)庫(kù)提供已發(fā)表的miRNA序列,注釋查詢,定位,發(fā)卡序列以及命名服務(wù)等信息的數(shù)據(jù)庫(kù)。

    該數(shù)據(jù)庫(kù)人工搜集了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證過(guò)的miRNA的靶基因,包括在人、小鼠、果蠅、蠕蟲(chóng)和斑馬魚(yú)中的miRNA的靶基因。

    四、miRNA產(chǎn)品選擇指南

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